RNA Seq analizi nedir?

[Admin]

RNA Seq analizi nedir?​

RNA Dizileme (RNA-Seq) Transkriptom, bir hücredeki transkriptlerin tamamı ve belirli gelişim evresinde yâda belirli bir fizyolojik durumdaki miktarlarıdır. Genomdaki fonksiyonel elementlerin çözülmesi ve hücre ve dokulardaki moleküler bileşenlerin açığa çıkarılmasında, transkriptomu anlamak önemlidir.

NGS analizi nasıl yapılır?​

NGS analizi nasıl yapılır?
NGS yöntemi eşler yardımıyla elde edilen yumurta ve spermlerin döllenmesiyle birlikte ortaya çıkan embriyolara uygulanır. Tarama testi sonucunda kromozomdaki değişimler tespit edilir. Testler sonucunda doğru önlem ile gebelik şansı bir hayli yükselmektedir.

Transkriptom analizi nedir?​

Transkriptom analizi nedir?
Transkriptom, bir hücrede bulunan bütün transkriptlerin çeşidinin ve miktarının eş zamanlı olarak incelenmesidir.

Transkriptom dizileme nedir?​

Transkriptom dizileme, belirli koşullar altında biyolojik bir numunede RNA’nın varlığını, miktarını ve yapısını ortaya çıkarmak için kullanılır.

Microarray ne işe yarar?​

Microarray ne işe yarar?
Örneğin microarray’ler hastalıklı ve normal bir hücrede gen ekspresyonunun karşılaştırılması suretiyle hastalık ile ala- kalı genlerin belirlenmesinde kullanılabil- mektedir. DNA microarray’leri aktif proteinlere çev- rilebilen ya da çevrilemeyen RNA’ların saptanmasında kullanılabilir.

NGS veri analizi nedir?​

NGS veri analizi nedir?
Yeni nesil dizileme (next-generation sequencing, NGS) genetik teknolojisi, tek bir örnekten alınan milyonlarca parçaya ayrılmış bir DNA molekülünün her bir parçasının aynı anda ve uyum içerisinde paralel olarak işlenmesini temel alır.

NGS sonucu kaç günde çıkar?​

Embriyonun blastokist dönemine ulaşması en erken yumurta toplama sonrası 5. günü bulmaktadır. İleri anne yaşı ve ağır erkek infertilitesi gibi durumlarda embriyoların gelişim hızı yavaşlayabilir ve bu nedenle embriyoların blastokist dönemine ulaşması 6. ve hatta 7.günü dahi bulabilir.

Genomun tanımı nedir?​

Genomun tanımı nedir?
Bir organizmanın kalıtım materyalinde bulunan genetik şifrelerin tamamını simgeler. Bir canlının gen ve kromozomlarındaki “genetik materyale” verilen addır. Canlıların en temel birimi olan hücrede fizikokimyasal özelliklerin ortaya çıkarılmasında kullanılan genetik talimatların hepsine de genom denilebilir.

Transkripsiyon nerede Sonlanir?​

Transkripsiyon nerede Sonlanir?
“Begin” etiketi, transkripsiyonun başladığı DNA’nın 5′ ucuna işaret etmekte, “End” de RNA sentezinin neredeyse bitmiş olduğu 3′ ucuna.

Microarray nedir tıp?​

DNA Mikroarray’i cam, plastik veya silikon çip gibi katı olan bir yüzeye tutturularak sıralı bir şekilde (array) oluşturulmuş mikroskobik DNA spotlarıdır. Yüzeye tutturulan DNA parçaları ( genellikle 20-100 nükleotid uzunluğunda ) prob olarak tanımlanmaktadır.

Micro array test nedir?​

Micro array test nedir?
Moleküler karyotipleme (Kromozomal Mikroarray Analizi), kromozomlar üzerinde yer alan mikro ve makro ölçekteki bozuklukları yüksek çözünürlüklü olarak tespit edilmesini sağlayan bir genetik analiz yöntemidir. Temelde, genomik kopya sayısı varyasyonların (CNV) bulunmasını sağlar.

NGS kimlere yapılır?​

NGS kimlere yapılır?
NGS uygulanabilen hasta grupları: 38 yaş üstü anne adayları Tekrarlayan tüp bebek başarısızlıkları Tekrarlayan gebelik kayıpları Ağır erkek faktör.

NGS mi PGT mi?​

Embriyoların anne rahmine yerleştirilmeden önce genetik açıdan ve kromozomlar yönünden incelenmesi işlemine PGT denir.

 

[Yapay-Zeka]

RNA Seq analizi, bir hücrede bulunan transkriptlerin çeşitliliğini ve miktarını belirlemek için kullanılan bir tekniktir. Bu analizde, hücrede bulunan RNA moleküllerinin dizilenmesi ve analiz edilmesi yoluyla hücrenin gen ifadesi profili belirlenir. RNA Seq analizi sayesinde hangi genlerin ne kadar aktif olduğu, hangi RNA tiplerinin bulunduğu ve gen ifadesindeki değişiklikler detaylı bir şekilde incelenebilir.

Transkriptom analizi ise bir hücredeki transkriptlerin çeşitliliğini ve miktarını belirlemek için yapılan geniş kapsamlı bir çalışmadır. Bu analizde, hücrede bulunan bütün transkriptlerin eş zamanlı olarak incelenmesi mümkün hale gelir ve hücredeki gen ifadesi hakkında detaylı bilgiler elde edilir.

Transkriptom dizileme ise belirli koşullar altında bir biyolojik numunedeki RNA'nın varlığını, miktarını ve yapısını belirlemek için kullanılan bir tekniktir. Bu yöntem sayesinde, hücrelerde hangi genlerin aktif olduğu, gen ifadesindeki değişiklikler ve hücreler arasındaki farklılıklar belirlenebilir.

Microarray analizi, hastalıklı ve normal hücreler arasındaki gen ifadesi farklılıklarını belirlemek için kullanılan bir tekniktir. Bu yöntemde, gen ifadesi profilleri karşılaştırılarak hastalıklı hücrelerde aktif olan veya olmayan genler belirlenebilir. Bu sayede hastalıkların tanısı, prognozu ve tedavisi üzerine değerli bilgiler elde edilebilir.

NGS veri analizi ise yeni nesil dizileme teknolojisi ile elde edilen milyonlarca DNA parçasının işlenmesini ve analiz edilmesini ifade eder. Bu analizde, genomdaki genetik varyasyonlar, mutasyonlar ve gen ifadesindeki değişiklikler belirlenerek genetik analizler yapılır.

Genom ise bir organizmanın kalıtım materyalinde bulunan genetik şifrelerin tümünü ifade eder. Yapılan araştırmalarda, genomdaki gen ifadesi, genetik hastalıkların nedenlerinin anlaşılması ve tedavi seçeneklerinin geliştirilmesi açısından büyük önem taşımaktadır.

Transkripsiyon, bir DNA molekülünün RNA'ya kopyalanması işlemidir ve bu süreç genellikle DNA'nın başlangıç ve bitiş bölgelerinde gerçekleşir. RNA sentezi, DNA'nın 5' ucundan 3' ucuna doğru ilerlerken transkripsiyonun sona erdiği bölgeyi işaretleyen "End" etiketiyle tamamlanır.

Microarray, tıpta gen ifadesi analizinde kullanılan bir teknolojidir. Mikroarray analizi sayesinde bir hücrede hangi genlerin aktif olduğu, hangi gen ifadesi profillerinin bulunduğu ve hastalıklı hücrelerdeki gen ifadesi farklılıkları belirlenebilir. Bu bilgiler hastalıkların teşhisi ve tedavisi için önemli ipuçları sağlar.

NGS (Next-Generation Sequencing) ise genetik analizlerde kullanılan bir teknolojidir ve milyonlarca DNA parçasının aynı anda dizilenmesine imkan tanır. NGS veri analizi, bu büyük miktardaki verilerin işlenmesini, gen varyasyonlarının belirlenmesini ve gen ifadesi profillerinin oluşturulmasını sağlar.

PGT (Preimplantasyon Genetik Tanı) ise embriyoların genetik ve kromozomal açıdan incelenmesi işlemidir. Bu yöntem, embriyoların anne rahmine transfer edilmeden önce genetik kusurların tespit edilmesine ve sağlıklı embriyoların seçilmesine olanak sağlar.