Molekuler marker nedir?

[Editör]

Moleküler marker nedir?​

Moleküler markörler, genomda herhangi bir gen bölgesi yada gen bölgesi ile ilişkili DNA parçasıdır. Bu markörler, polimeraz zincir reaksiyonuna bağlı olmayanlar (RFLP) ve bağlı olanlar (RAPD, AFLP, SSR) olarak adlandırılmaktadır (Staub ve ark., 1996; Ridout ve Donini, 1999). İlk keşfedilen moleküler markör sistemidir.

SSCP yontemi nedir?​

SSCP, tek zincir DNAnın molekül içi etkileşimi sonucu her zincirin farklı formda katlanıp kıvrılması ile değişik konformasyonların (=ikincil yapının) oluşmasına ve poliakrilamid jel elektroforezinde farklı hızda hareket etmesi üzerine kurulmuş bir yöntemdir.

SSCP analizi nedir?​

SSCP analizi nedir?
SSCP analizi, denatüre edici olmayan şartlar altında tek zincir DNA molekülündeki tek veya çoklu nükleotid değişikliklerinin, elektroforetik mobiliteyi değiştirme etkisine dayanarak mutasyonları saptayabilen bir uygulamadır.

SSR yöntemi nedir?​

SSR yöntemi nedir?
Mikrosatelitler (mikro uydu), Basit dizi tekrarları (İngilizce Simple Sequence Repeats veya SSR), veya Kısa Bitişik Tekrarlar (İng. Short Tandem Repeats) DNA’da bulunan, 1-6 baz çifti uzunluğundaki tekrar eden dizilerdir. Mikrosatelitler genetik anlamda nötral ve eş-baskındır (codominant).

Genetik markörler nelerdir?​

Moleküler markörler; genetik markörlerin, DNA tabanlı tipini oluşturduklarından, DNA markörleri olarak da bilinirler. DNA markörleri farklı genotiplere ait DNA diziliş farklılığını çeşitli şekillerde ortaya koyan markörlerdir.

ITS bölgesi ne demek?​

ITS bölgeleri ribozomal RNA içerisinde tekrarlanan bir bölgedir. Bu bölgede 5′ external transcribed sequence (5′ ETS), 18S rRNA, ITS1, 5.8S rRNA, ITS2, 28S rRNA ve son olarak da 3′ ETS bölgeleri bulunmaktadır.

Mutasyon saptama yöntemleri nelerdir?​

Mutasyon saptama yöntemleri nelerdir?
Mutasyon saptama oran› %90-95 tir. Bu yöntemde PCR, transkripsiyon ve trans- lasyon birarada kullan›l›r.

SSR analizi nedir?​

SSR analizi nedir?
SSR (Simple sequence repeat) markörleri DNA parmak izi çalışmalarında kullanılır ancak bu markörlerin kullanımında sekans bilgisine ihtiyaç duyulur. Bu çalışmanın amacı da, yeni nesil sekanslama kullanılarak yeni SSR markörleri geliştirmek ve geliştirilen markörler kullanılarak genetik çeşitliliği belirlemektir.

Qtl analizi nedir?​

Nicel bir özelliğe katkıda bulunan çoklu genler nicel özellik lokusları (Quantitative trait loci =QTLs) olarak bilinir. Bu lokusların tanımlanması, nicel bir özellikle ilgili kaç tane genin bulunduğunun belirlenmesi ve bu genlerin, diğer genlere göre fenotipi daha çok etkileyip etkilemediği hakkında bilgi verir.

Genetik belirteç nedir?​

Belirteç ya da markör genetik açıdan tanımlandığında, DNA’nın bir bölümünü tarifler ancak genomun belirli bir noktasını işaret ettiğinden bu adı alır. Populasyonların genetik çeşitliliklerinin belirlenmesi için yapılan ilk çalışmalar morfolojik özelliklere dayanmaktadır.

Gen piramidi nedir?​

Gen piramidi nedir?
Aynı karaktere etki eden birden fazla genin aynı genotip içinde toplanmasına gen piramidi denilmektedir. Bu yöntem özellikle aynı hastalığa dayanıklılık sağlayan farklı özellikteki genlerin aynı genotipte toplanmasını ve kalıcı bir dayanıklılık sağlanmasını temin eder.

ITS PCR nedir?​

ITS PCR nedir?
In Situ PCR; Lam üzerindeki hücre, doku ya da doku parçaları içindeki kalıp DNA’nın PCR ile çoğaltılması işlemidir. Bu yöntem viral DNA’nın ve tek kopyalı genlerin saptanmasında veya RT-PCR ile birlikte viral RNA ve transkriptlerin belirlenmesinde kullanılmaktadır.

ITS gen bölgesi nedir?​

 

[Yapay-Zeka]

Moleküler markerlar, genetik çeşitliliği ve genotipleri belirlemek, genetik haritalama ve popülasyon genetiği çalışmalarında kullanılan önemli araçlardır. Bu markerlar genellikle DNA dizilimindeki farklılıkları veya tekrar eden dizilimleri tespit etmek için kullanılırlar. Genellikle genomdaki belirli bir bölge ya da gen ile ilişkilendirilen DNA parçaları olarak tanımlanırlar. Moleküler markerler, polimeraz zincir reaksiyonuna bağlı olanlar ve olmayanlar olarak iki ana gruba ayrılır.

SSCP yöntemi (Tek Zincir Konformasyon Polimorfizmi), tek zincir DNA'nın farklı konformasyonlarının elektroforezde farklı hareket etmesine dayanan bir tekniktir. Bu yöntem, tek veya çoklu nükleotid değişikliklerini belirleyerek mutasyonları tespit etmede kullanılır.

SSR yöntemi (Simple Sequence Repeat), mikrosatelitler veya basit dizi tekrarları olarak da bilinen kısa tekrar eden dizileri hedefler. Bu tekrar eden diziler genetik açıdan nötral ve eş-baskındır, yani her iki ebeveynden gelen genetik materyali aynı anda ifade edebilirler. SSR analizi genellikle genetik çeşitlilik çalışmalarında kullanılır ve genotipler arasındaki farkları belirlemeye yardımcı olur.

QTL analizi (Nicel Özellik Lokusu Analizi), nicel bir özelliğin arkasındaki genetik faktörleri belirlemek için kullanılan bir yöntemdir. Bu analiz, bir nicel özelliği etkileyen çoklu genlerin lokasyonlarını ve etkilerini belirlemeye yardımcı olur.

Genetik belirteçler, genomdaki belirli bir bölgeyi işaret eden DNA segmentleridir. Genotipler arasındaki genetik farklılıkları belirlemek için kullanılırlar ve popülasyonların genetik çeşitliliğini araştırmak için önemli bir araçtır.

Gen piramidi, aynı karakter üzerinde etkili olan birden fazla genin belirli bir genotipte bir araya gelmesini ifade eder. Bu yöntem genellikle bitki ve hayvan ıslahında kullanılarak aynı hastalığa karşı dayanıklılığı artırmak amacıyla farklı genlerin bir araya getirilmesini sağlar.

ITS bölgesi (Internal Transcribed Spacer), ribozomal RNA moleküllerinde tekrarlanan bir bölgedir. Bu bölge, genetik çalışmalarda ve türler arasındaki ilişkilerin belirlenmesinde önemli bir rol oynar. ITS PCR ise bu bölgenin çoğaltılması için kullanılan bir tekniktir.

Genetik markörler ve analiz yöntemleri genetik araştırmalarda önemli bir rol oynar ve genetik çeşitliliği belirlemede, türler arası ilişkilerin incelenmesinde ve ıslah çalışmalarında kullanılan değerli araçlardır.