1998-1999 sezonun da henüz 16 yaşındayken Hatayspor'da forma giymeye başlayan Gökhan Zan, 2000-2001 sezounda 18 yaşındayken Çanakkale Dardanelspor transfer olmuştur. 3 sezon boyunca Dardanelspor forması giyen Gökhan Zan, buradaki başarılı performansı sonrasında 2003-2004 sezounda Beşiktaş'a transfer olmuştur.
Sporcu, Beşiktaş takımındaki ilk senesinde kendini gösterememiş ve tecrübe kazanmak üzere 2004-2005 sezounda Gaziantepspor'a kiralanmıştır.
2005-2006 sezonu başında Beşiktaş'a dönerek kadroya girmeyi başarmıştır. 1,92 m boyu ile Süper Lig'deki en uzun futbolculardan bir olan Gökhan Zan, iri ve güçlü fiziği ile öne çıkan defans oyuncusudur. ve bunun yanı sıra toplara sert vurabilmektedir. Sık sık sakatlık sorunlarıyla boğuşan futbolcu, 2008-2009Beşiktaş'la sözleşme yenilemiştir. sezonunda
Sporcu, Beşiktaş takımındaki ilk senesinde kendini gösterememiş ve tecrübe kazanmak üzere 2004-2005 sezounda Gaziantepspor'a kiralanmıştır.
2005-2006 sezonu başında Beşiktaş'a dönerek kadroya girmeyi başarmıştır. 1,92 m boyu ile Süper Lig'deki en uzun futbolculardan bir olan Gökhan Zan, iri ve güçlü fiziği ile öne çıkan defans oyuncusudur. ve bunun yanı sıra toplara sert vurabilmektedir. Sık sık sakatlık sorunlarıyla boğuşan futbolcu, 2008-2009Beşiktaş'la sözleşme yenilemiştir. sezonunda