Gen ekspresyon analizi nedir?

[Admin]

Gen ekspresyon analizi nedir?​

Gen ekspresyon analizi, gen ürünlerini görüntüleyerek, çoğaltarak, prob hibridizasyon ya da sekans-tabanlı tespit yöntemleriyle çalışmaktır. cDNA analizi ise cDNA kütüphaneleri oluşturduktan sonra bunların ekspresyon analizlerimi yaparak genler hakkında bilgi toplamaktır.

Pairwise sequence alignment nedir?​

Çoklu dizi hizalaması, üç ya da çok biyolojik dizinin (genelde protein, DNA veya RNA dizisinin) dizi hizalamasıdır. Üç veya daha çok dizinin elle hizalanması zor olduğu ve genelde çok zaman alıcı olduğu için hizalamaların üretim ve analizi için berimsel (hesaplamalı) algoritmalar kullanılır.

Epistasi nedir örnek?​

Epistasi nedir örnek?
Epistatik genlerin her ikiside resesif olduğundan bu kalıtım şekline çift resesif epistazi denmektedir. Bu kalıtıma komplementer kalıtım da denmektedir. Bu kalıtımın en tipik örneği tavuklarda bacakların tüylü veya tüysüz olmasını sağlayan genlerdir.

Dizi hizalaması Filogenetik analizde neden önemlidir?​

Filogenetik analiz (Ana|Berimsel filogenetik) Filogenetik ve dizi hizalaması birbiriyle yakından ilişkili sahalardır çünkü ikisi de dizi yakınlığı belirlemesi yapar. Filogenetik sahası, filogenetik ağaçların inşası ve yorumlamasında dizi hizalamasından yararlanır.

Gen ekspresyon ne demek tıp?​

Gen ifadesi ya da Gen ekspresyonu, DNA dizisi olan genlerin, fonksiyonel protein yapılarına dönüşmesi süreci için kullanılan bir terimdir. Basitçe, bu durum genlerin açık (aktif) olup olmadıkları olarak da tanımlanabilir.

CpG ne demek?​

CpG ne demek?
1) CpG adacık metilasyonu, DNA replikasyonu sırasında oluşan hataların sonucu olan rastgele bir süreçtir. Bu hatalar, sapmış metilasyonun üstünü kaplamasıyla ve DNA metiltransferaz aktivitesiyle, ek olarak metillenmiş büyüme-baskılayıcı genlerin bulunduğu hücrelerin seçilimiyle sabitlenir.

Sekans Homolojisi nedir?​

Sekans homolojisi, sekanslar arasındaki evrimsel ilişkiyi gösteren daha genel bir terimdir. İki sekansı karşılaştırırken sekans homolojisi yüzdesinden bahsetmek yaygındır, ancak bu yüzde aynı ve benzer alanların bir karışımını içerebilir. Son olarak, dizi homolojisi diziler arasındaki evrimsel ilişkiyi ifade eder.

Blast ne için kullanılır?​

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) biyoinformatik çalışmalarda kullanılan GenBank veri tabanına ait, nükleik asit ve protein sekanslarının analizini yapmaya yarayan bir hizalama arama motorudur.

Genler arasındaki etkileşimler nelerdir?​

Genler arasındaki etkileşimler nelerdir?
Gen interaksiyonları Allel ve allel olmayan genlerin hem kendş aralarında ve hemde çevresel faktörlerle olan etkileşimlerine gen interaksiyonları denir. Gen interaksiyonları allel, allel olmayan, hem allel hemde allel olmayan genler arasındaki etkileşimle ile cinsiyet hormonlarının etkisi ile meydana gelir.

Epistaz Hipostaz nedir?​

Bir özelliğin oluşmasında görev alan gen çiftlerinden daha güçlü olanın güçsüz olan gen çifti üzerinde baskı kurması ve buna bağlı olarak fenotipte kendine özgü özelliği meydana getirmesine EPİSTAZ denir. Bu olayın tersine yani güçsüz olan gen çiftinin fenotipte kendi özelliğini göstermemesine ise HİPOSTAZ denir.

Filogenetik sınıflandırma yapılırken dikkate alınan özellikler nelerdir?​

Bu özellikler şunlardır:
- köken benzerlikleri.
- akrabalık dereceleri.
- sahip oldukları homolog organlar.
- hücre tipi ve sayısı (sitoloji)
- protein benzerliği (DNA’nın nükleotit dizilim benzeşmesi)
- embriyolojik gelişim.
- fizyolojik benzerlikler.
- beslenme şekli.

Filogenetik analiz ne demek?​

Filogenetik analiz ne demek?
Filogenetik; bir türdeki tüm bireyleri, zaman içinde soy olarak bağlantılı bireyler olarak kabul eder. Filogenetik analizde DNA ya da protein dizileri kullanılarak genom benzerlikleri bulunur. Bu dizilere ait bilginin özetlenmesi ve görsel olarak anlaşılabilmesi için filogenetik ağaçlar oluşturulur ve kullanılır.

 

[Yapay-Zeka]

Gen ekspresyon analizi, bir organizmadaki genetik materyalin fonksiyonel ürünlere dönüşme sürecini inceleyen bir araştırma alanıdır. Bu analiz gen ürünlerini görüntüleyerek, çoğaltarak, prob hibridizasyon veya sekans-tabanlı tespit yöntemleriyle gerçekleştirilir. Gen ekspresyon analizinde gen ifadesinin ne kadar olduğu, hangi genlerin aktif olduğu, belirli koşullarda hangi genlerin etkilendiği gibi soruların cevapları aranır.

Öte yandan cDNA analizi, gen ifadesini anlamak için yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir. Bu analizde öncelikle hücrelerden mRNA'nın türetilmesi ve daha sonra bu RNA'nın kopyalanarak cDNA kütüphanelerinin oluşturulması işlemi yapılır. Sonrasında, bu cDNA'ların gen ekspresyon analizleri yapılarak genler hakkında detaylı bilgi elde edilir.

Gen ekspresyon analizi ve cDNA analizi genetik araştırmalarda gen ifadesini anlamak, gen düzenleme mekanizmalarını anlamak, hastalıkların tanısında ve tedavisinde potansiyel hedeflerin belirlenmesinde etkili araçlardır. Bu analizlerin sonuçları genetik regülasyonun anlaşılmasına katkıda bulunur ve karmaşık genetik etkileşimlerin açıklanmasına yardımcı olabilir.