Alfa heliks yapisi nedir?

[Admin]

Alfa heliks yapısı nedir?​

En yaygın olarak gözlenen ikincil yapılar α-heliks ve β- tabakadır (Şekil 1. 5). α-Heliks, her 4 amino asitte bir kurulan kovalent olmayan H bağları ile şeklini koruyan kıvrımlı bir yapıdır ve kıvrımlı yapısından dolayı dayanıklı bir formdur.

Alfa heliks nasıl oluşur?​

Alfa heliks nasıl oluşur?
Globuler proteinlerde, ve ayrıca sarımlı sarım ve lösin fermuarı gibi özelleşmiş yapılarda, bir alfa sarmal iki “yüz” sergiler: biri proteinin içine yönelik başlıca hidrofobik amino asitlerden oluşmuştur, öbürü ise proteinin çözeltiye temas eden yüzeyinde yer alan polar amino asitlerden oluşur.

Alfa sarmal yapı nedir?​

Alfa sarmal yapı nedir?
Protein yapısında yaygın olarak bulunan ikincil bir üç boyutlu yapıdır. Bu dizilimde aminoasitler her peptit içerisindeki karboksil oksijen moleküllerinin hidrojen bağları ile dengelenmesi sayesinde spiral bir yapıda bulunurlar. Miyoglobin ve hemoglobin proteinlerinin p civarı alfa sarmal yapısındadır.

Alfa Helix beta sheet nedir?​

Proteinlerin ikincil yapısında β yaprak (β plili yaprak olarak da adlandırılır), alfa sarmaldan sonra en sık görülen biçimdir. Beta yapraklar birbirine en az iki veya üç hidrojen bağı ile yatay bağlanmış beta ipliklerden oluşur, bunlardan plili ve burkulmuş bir yaprak meydana getirir.

Kuaterner yapı ne demek?​

Kuaterner yapı ne demek?
Çoğu protein polipeptit zincirlerinden oluşur. Bu polipeptitiler aynı olabilir (bir homodimerde olduğu gibi) veya farklı olabilir (bir heterodimerde olduğu gibi). Kuaterner yapı, bu polipeptitlerin birbirleriyle etkileşime girdiğine ve daha büyük bir protein kompleksi oluşturduklarında verilen isimdir.

Kaotropik madde ne demek?​

Kaotropik madde ne demek?
Konformasyon değişikliği biyolojik aktiviteyi engeller. gibi non*kovalent etkileşimleri bozan maddelere kaotropik maddeler denilir.

Alfa amino asit ne demek?​

Alfa amino asitler alfa karbon ataomuna bir amino grubu (-NH2), bir karboksil grubu (-COOH), bir hidrojen atomu (H) ve bir yan grubun bağlanmasıyla oluşan bileşiklerdir. Protein yapıtaşı olarak bugüne kadar 20 adet amino asidinin varlığı saptanmıştır. Bu amino asitlerden en basiti GLİSİN dir.

Ikincil yapı nedir?​

Ikincil yapı nedir?
İkincil yapının resmî tanımı, bir biyopolimerin hidrojen bağı yapıları ile tanımlanabilir; bunlar atomik çözünürlüklü bir yapı aracılığıyla ile belirlenir. Proteinler durumunda, ikincil yapı, protein omurgasındaki amit ve karboksil grupları arasındaki hidrojen bağlarının örüntüsü ile tanımlanır.

Tersiyer yapı ne demek?​

Tersiyer yapı ne demek?
Bir proteinin polipeptit zincirinin primer ve sekonder yapılarının ilişkisi ile oluşan üç boyutlu konformasyonu. Polipeptit zincirlerinin birbirine bağlanarak oluşturduğu üç boyutlu yapı.

Kuarter yapı ne demek?​

kuaterner yapı ne demek? Proteinlerde birkaç polipeptit zincirinin birbirleriyle çeşitli ilişkileri sonucu oluşan yapı. Quaternary structure.

Disülfit bağı ne demek?​

Disülfit bağı ne demek?
Bir proteinin farklı bölümlerinde veya iki farklı protein arasında iki sistein kalıntısı arasındaki kovalent bağ.

Denatürasyona örnek nelerdir?​

Denatürasyona örnek nelerdir?
Yumurtanın sahanda pişirilmesi sonucunda yumurtanın ısı etkisiyle katılaşması ve beyaza dönmesi denatürasyona bir örnektir. Kaynamış sütün üzerinde oluşan kaymak da bir denatürasyon olayıdır. Yumurta akının denatürasyonunun geri dönüşümsüz olmasına rağmen diğer birçok denatürasyon olayı geri dönüşümlüdür.

Alfa amino asitler nelerdir?​

Heliks yapısı nedir?​

Heliks yapısı nedir?
Kollajen heliks, üçüncü yapısal motif; kollajen heliksidir. Bu yapı deri, kemik ve eklemlerin başlıca proteini olan kollajenin yüksek gerilme gücünü sağlayan özelliğini verir. Bütün kollajen moleküllerinde glisin sayısı bütün amino asitlerin 3’te biri kadardır.
α-sarmallar biyolojik membranları içinden geçen en yaygın protein yapı elemanıdır. Bunun nedeni, sarmal yapının, omurgadaki tüm hidrojen bağlarının dahilî olarak oluşmasını ve, eğer yan zincirler hidrofobikse, membran ile temas halinde hiçbir polar grup kalmamasını, sağlamasıdır.

 

[Yapay-Zeka]

Alfa heliks yapısı, proteinlerin ikincil yapısındaki önemli bir yapısal motif olarak karşımıza çıkar. Her 4 amino asitte bir kovalent olmayan H bağları ile korunan kıvrımlı bir yapıya sahiptir ve bu sayede dayanıklı bir forma sahiptir. Alfa heliks, genellikle globüler proteinlerde ve özelleşmiş yapılarında gözlemlenir. Bir alfa sarmal, proteinin içine doğru yönelen hidrofobik amino asitler ve çözeltiyle temas eden yüzeyinde yer alan polar amino asitlerden oluşan iki "yüzü" bulunur.

Alfa sarmal yapısı ise proteinlerde yaygın olarak bulunan ikincil bir üç boyutlu yapıdır. Amino asitlerin karboksil oksijen molekülleri arasındaki hidrojen bağları ile dengelenmesi sonucunda spiral bir yapı oluştururlar. Örneğin, miyoglobin ve hemoglobin gibi proteinlerin alfa sarmal yapısına sahip olduğu bilinmektedir.

Alfa heliks ile birlikte yaygın olarak görülen bir diğer ikincil yapı ise beta yaprak veya beta tabaka olarak adlandırılan yapıdır. Beta yapraklar, en az iki veya üç hidrojen bağı ile birbirine bağlanmış yatay beta ipliklerden oluşur ve bu iplikler plili ve burkulmuş bir yapı meydana getirir.

Proteinlerin üçüncül yapısı arasında yer alan tersiyer yapı, bir proteinin polipeptit zincirinin primer ve ikincil yapılarının ilişkisiyle oluşan üç boyutlu konformasyonunu ifade eder. Ayrıca, kuaterner yapı ise birkaç polipeptit zincirinin birbirleriyle etkileşime girerek oluşturdukları yapıyı ifade eder. Bu yapı, polipeptit zincirlerin bir araya gelerek daha büyük bir protein kompleksi oluşturduğu durumları kapsar.

Kuarter yapı terimi genellikle kuaterner yapı ifadesinin yanlış yazımı olarak karşımıza çıkar. Kuarter yapı, aslında kuaterner yapı ile aynı şeydir ve birden fazla polipeptit zincirinin etkileşime girerek oluşturduğu yapıyı tanımlar.

Denatürasyon ise protein yapısındaki değişiklikleri ifade eden bir terimdir. Bu değişiklikler genellikle proteinin üç boyutlu yapısının bozulmasıyla sonuçlanır. Örneğin, yumurtanın pişirilmesi sonucunda beyazlaşması ve sütün kaynama sonucu oluşan kaymak gibi olaylar denatürasyona örnek olarak verilebilir.

Son olarak, alfa amino asitler alfa karbon atomuna bağlı bir amino grubu, bir karboksil grubu, bir hidrojen atomı ve bir yan zincirin bulunduğu bileşiklerdir. Bugüne kadar protein yapıtaşları olarak kabul edilen 20 farklı amino asit tanımlanmıştır, en basiti ise glisin olarak bilinir. Bu amino asitler, proteinlerin yapısal ve işlevsel çeşitliliğini sağlarlar.